| Nº cap. | Título | Documento | Mapa/s |
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| | Portada | | |
| | Portada interior | | |
| | Índice general | | |
| 1 | Introducción y resumen del informe de situación | | |
| 2 | Ríos. Evaluación del estado de las masas de agua | | |
| 3 | Embalses. Evaluación del estado de las masas de agua | | |
| 4 | Lagos. Evaluación del estado de las masas de agua | | |
| 5 | Aguas subterráneas. Evaluación del estado de las masas de agua | | |
| | Introducción | | |
| | 5.1 Control de vigilancia de aguas subterráneas | | |
| | 5.2 Control operativo de aguas subterráneas. Red de control de nitratos (RNIT) - Red de tendencias (RTEND) | | |
| | 5.3 Control operativo de aguas subterráneas. Red de control de contaminaciones industriales (RCON) | | |
| | 5.4 Control operativo de aguas subterráneas. Red de control de plaguicidas (RPLAG) | | |
| | 5.5 Evaluación del estado químico de aguas subterráneas | | |
| 6 | Control de zonas protegidas | | |
| 7 | Especies exóticas invasoras de aguas continentales | | |
| | Glosarios de términos y abreviaturas | | |
